MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rhodopirellula baltica SH 1 chromosome

Total Repeats: 141663

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_005027	TTC	2	6	30	35	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	32470667
2	NC_005027	TCT	2	6	52	57	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	32470667
3	NC_005027	TTG	2	6	63	68	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	32470667
4	NC_005027	GCC	3	9	108	116	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	32470667
5	NC_005027	CAAC	2	8	121	128	50 %	0 %	0 %	50 %	32470667
6	NC_005027	GATG	2	8	194	201	25 %	25 %	50 %	0 %	32470668
7	NC_005027	AATT	2	8	232	239	50 %	50 %	0 %	0 %	32470668
8	NC_005027	A	8	8	332	339	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_005027	CAA	2	6	382	387	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10	NC_005027	TCG	2	6	452	457	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	32470669
11	NC_005027	CGG	2	6	488	493	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	32470669
12	NC_005027	CTTG	2	8	542	549	0 %	50 %	25 %	25 %	32470669
13	NC_005027	CGA	2	6	560	565	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	32470669
14	NC_005027	ATCG	2	8	706	713	25 %	25 %	25 %	25 %	32470669
15	NC_005027	ATC	2	6	823	828	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	32470669
16	NC_005027	CTT	2	6	891	896	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	32470669
17	NC_005027	TCT	2	6	959	964	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	32470669
18	NC_005027	TCT	2	6	971	976	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	32470669
19	NC_005027	CGT	3	9	1022	1030	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	32470669
20	NC_005027	GCCATC	2	12	1035	1046	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	32470669
21	NC_005027	CGAAG	2	10	1059	1068	40 %	0 %	40 %	20 %	32470669
22	NC_005027	CGT	2	6	1070	1075	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	32470669
23	NC_005027	CGT	2	6	1082	1087	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	32470669
24	NC_005027	GTCGTA	2	12	1089	1100	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	32470669
25	NC_005027	CGT	2	6	1127	1132	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	32470669
26	NC_005027	GTA	2	6	1167	1172	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	32470669
27	NC_005027	GTA	2	6	1209	1214	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	32470669
28	NC_005027	TTG	2	6	1225	1230	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	32470669
29	NC_005027	TCG	2	6	1315	1320	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	32470669
30	NC_005027	TAA	2	6	1381	1386	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	32470669
31	NC_005027	TCCCAT	2	12	1399	1410	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	32470669
32	NC_005027	CGT	2	6	1483	1488	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	32470669
33	NC_005027	GTAG	2	8	1495	1502	25 %	25 %	50 %	0 %	32470669
34	NC_005027	CGTTCA	2	12	1551	1562	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	32470670
35	NC_005027	CGT	2	6	1568	1573	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	32470670
36	NC_005027	A	6	6	1605	1610	100 %	0 %	0 %	0 %	32470670
37	NC_005027	TGT	2	6	1724	1729	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
38	NC_005027	CGG	2	6	1786	1791	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	32470671
39	NC_005027	TGCA	2	8	1835	1842	25 %	25 %	25 %	25 %	32470671
40	NC_005027	CTC	2	6	1856	1861	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	32470671
41	NC_005027	CGG	2	6	1948	1953	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	32470671
42	NC_005027	CCA	2	6	1958	1963	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	32470671
43	NC_005027	CCA	2	6	2013	2018	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	32470671
44	NC_005027	TCGT	2	8	2081	2088	0 %	50 %	25 %	25 %	32470671
45	NC_005027	CAC	2	6	2150	2155	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	32470671
46	NC_005027	CCA	2	6	2218	2223	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	32470671
47	NC_005027	CCG	2	6	2361	2366	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	32470671
48	NC_005027	CG	3	6	2438	2443	0 %	0 %	50 %	50 %	32470671
49	NC_005027	GGC	2	6	2463	2468	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	32470671
50	NC_005027	TGA	2	6	2743	2748	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	32470671
51	NC_005027	TCG	2	6	2757	2762	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	32470671
52	NC_005027	TCGCG	2	10	2800	2809	0 %	20 %	40 %	40 %	32470671
53	NC_005027	GCA	2	6	2812	2817	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	32470671
54	NC_005027	TGA	2	6	2860	2865	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	32470671
55	NC_005027	ACC	2	6	3053	3058	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	32470671
56	NC_005027	GTT	2	6	3201	3206	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	32470671
57	NC_005027	CGT	2	6	3217	3222	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	32470671
58	NC_005027	CAC	2	6	3505	3510	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	32470671
59	NC_005027	TCA	2	6	3555	3560	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	32470671
60	NC_005027	GCG	2	6	3594	3599	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	32470671
61	NC_005027	GGC	2	6	3643	3648	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	32470671
62	NC_005027	AATCG	2	10	3711	3720	40 %	20 %	20 %	20 %	32470671
63	NC_005027	GGCAC	2	10	3736	3745	20 %	0 %	40 %	40 %	32470671
64	NC_005027	CGGACG	2	12	3827	3838	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	32470671
65	NC_005027	GCA	2	6	3844	3849	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	32470671
66	NC_005027	GGCC	2	8	3877	3884	0 %	0 %	50 %	50 %	32470671
67	NC_005027	TCGA	2	8	3918	3925	25 %	25 %	25 %	25 %	32470671
68	NC_005027	CGC	2	6	3985	3990	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	32470671
69	NC_005027	GCA	2	6	3991	3996	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	32470671
70	NC_005027	CGG	2	6	4018	4023	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	32470671
71	NC_005027	TCG	2	6	4056	4061	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	32470671
72	NC_005027	CCG	2	6	4101	4106	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	32470671
73	NC_005027	CGAC	2	8	4147	4154	25 %	0 %	25 %	50 %	32470671
74	NC_005027	TCG	2	6	4203	4208	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	32470671
75	NC_005027	CATCGT	2	12	4262	4273	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	32470671
76	NC_005027	TGA	2	6	4325	4330	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	32470671
77	NC_005027	TTC	2	6	4359	4364	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	32470671
78	NC_005027	TTCGAC	2	12	4415	4426	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	32470671
79	NC_005027	CAA	3	9	4439	4447	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	32470671
80	NC_005027	GGCC	2	8	4507	4514	0 %	0 %	50 %	50 %	32470671
81	NC_005027	GTC	2	6	4547	4552	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	32470671
82	NC_005027	GT	3	6	4562	4567	0 %	50 %	50 %	0 %	32470671
83	NC_005027	GCGAT	2	10	4582	4591	20 %	20 %	40 %	20 %	32470671
84	NC_005027	CAA	2	6	4613	4618	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	32470671
85	NC_005027	GTG	2	6	4714	4719	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	32470671
86	NC_005027	CGG	2	6	4780	4785	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	32470671
87	NC_005027	TCG	2	6	4808	4813	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	32470671
88	NC_005027	TCA	2	6	4821	4826	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	32470671
89	NC_005027	CGC	2	6	4841	4846	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	32470671
90	NC_005027	GCC	2	6	4865	4870	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	32470671
91	NC_005027	GCGA	2	8	4904	4911	25 %	0 %	50 %	25 %	32470671
92	NC_005027	ACC	2	6	4924	4929	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	32470671
93	NC_005027	CGG	2	6	4933	4938	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	32470671
94	NC_005027	GT	3	6	4942	4947	0 %	50 %	50 %	0 %	32470671
95	NC_005027	CCG	2	6	5016	5021	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	32470671
96	NC_005027	TCG	2	6	5031	5036	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	32470671
97	NC_005027	TGC	2	6	5067	5072	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	32470671
98	NC_005027	TGC	2	6	5156	5161	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	32470671
99	NC_005027	A	6	6	5292	5297	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_005027	GCG	2	6	5424	5429	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
101	NC_005027	ACCGA	2	10	5434	5443	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
102	NC_005027	CTA	2	6	5444	5449	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
103	NC_005027	CGG	2	6	5471	5476	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	32470672
104	NC_005027	GTT	2	6	5533	5538	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	32470672
105	NC_005027	GGT	2	6	5558	5563	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	32470672
106	NC_005027	TG	3	6	5575	5580	0 %	50 %	50 %	0 %	32470672
107	NC_005027	TTG	2	6	5618	5623	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	32470672
108	NC_005027	CGAA	2	8	5703	5710	50 %	0 %	25 %	25 %	32470672
109	NC_005027	GGCG	2	8	5727	5734	0 %	0 %	75 %	25 %	32470672
110	NC_005027	T	6	6	5804	5809	0 %	100 %	0 %	0 %	32470672
111	NC_005027	GTT	2	6	6113	6118	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	32470673
112	NC_005027	CGG	2	6	6153	6158	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	32470673
113	NC_005027	CGA	2	6	6180	6185	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	32470673
114	NC_005027	CTT	2	6	6186	6191	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	32470673
115	NC_005027	GCG	2	6	6220	6225	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	32470673
116	NC_005027	CGT	2	6	6245	6250	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	32470673
117	NC_005027	GCC	2	6	6259	6264	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	32470673
118	NC_005027	GCC	2	6	6390	6395	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	32470673
119	NC_005027	CTGC	2	8	6397	6404	0 %	25 %	25 %	50 %	32470673
120	NC_005027	CAATT	2	10	6444	6453	40 %	40 %	0 %	20 %	32470673
121	NC_005027	CCA	2	6	6464	6469	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	32470673
122	NC_005027	CGC	3	9	6486	6494	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	32470673
123	NC_005027	CGG	2	6	6600	6605	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	32470673
124	NC_005027	CTG	2	6	6631	6636	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	32470673
125	NC_005027	GAC	3	9	6658	6666	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	32470673
126	NC_005027	TCG	2	6	6698	6703	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	32470673
127	NC_005027	CGC	2	6	6747	6752	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	32470673
128	NC_005027	GCGAT	2	10	6837	6846	20 %	20 %	40 %	20 %	32470673
129	NC_005027	TGC	2	6	6944	6949	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	32470673
130	NC_005027	GGTTT	2	10	6989	6998	0 %	60 %	40 %	0 %	32470673
131	NC_005027	CGA	2	6	6999	7004	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	32470673
132	NC_005027	CGG	2	6	7025	7030	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	32470673
133	NC_005027	CGC	3	9	7119	7127	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	32470673
134	NC_005027	GGT	2	6	7257	7262	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	32470673
135	NC_005027	CGC	2	6	7298	7303	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	32470673
136	NC_005027	GGAC	2	8	7465	7472	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
137	NC_005027	GGC	2	6	7499	7504	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
138	NC_005027	GGAC	2	8	7647	7654	25 %	0 %	50 %	25 %	32470674
139	NC_005027	TGG	2	6	7739	7744	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	32470674
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141	NC_005027	GGAC	2	8	7829	7836	25 %	0 %	50 %	25 %	32470674
142	NC_005027	TGG	2	6	7921	7926	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	32470674
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144	NC_005027	GGAC	2	8	8011	8018	25 %	0 %	50 %	25 %	32470674
145	NC_005027	TGG	2	6	8103	8108	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	32470675
146	NC_005027	GGAC	2	8	8193	8200	25 %	0 %	50 %	25 %	32470675
147	NC_005027	TGG	2	6	8285	8290	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	32470676
148	NC_005027	TC	3	6	8312	8317	0 %	50 %	0 %	50 %	32470676
149	NC_005027	CTGG	2	8	8361	8368	0 %	25 %	50 %	25 %	32470676
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262	NC_005027	GAA	2	6	13849	13854	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	32470679
263	NC_005027	CGCGA	2	10	13923	13932	20 %	0 %	40 %	40 %	32470679
264	NC_005027	CGAT	2	8	13944	13951	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
265	NC_005027	T	6	6	13995	14000	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
266	NC_005027	TGCT	2	8	14002	14009	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
267	NC_005027	TCA	2	6	14034	14039	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
268	NC_005027	CCG	2	6	14041	14046	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
269	NC_005027	CTG	2	6	14083	14088	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	32470680
270	NC_005027	GCA	2	6	14171	14176	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	32470680
271	NC_005027	GAA	2	6	14251	14256	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	32470680
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273	NC_005027	CAT	2	6	14328	14333	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	32470680
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275	NC_005027	ACG	2	6	14408	14413	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	32470680
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277	NC_005027	TCA	2	6	14480	14485	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	32470680
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291	NC_005027	GGT	2	6	15190	15195	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
292	NC_005027	CCG	2	6	15220	15225	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
293	NC_005027	TCG	2	6	15279	15284	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
294	NC_005027	TCC	2	6	15298	15303	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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298	NC_005027	GTC	2	6	15375	15380	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
299	NC_005027	AGG	2	6	15411	15416	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
300	NC_005027	AG	3	6	15432	15437	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
301	NC_005027	TAC	2	6	15440	15445	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
302	NC_005027	TCG	2	6	15478	15483	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	32470682
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307	NC_005027	CCG	2	6	15676	15681	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
308	NC_005027	CAAG	2	8	15787	15794	50 %	0 %	25 %	25 %	32470683
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392	NC_005027	TCG	2	6	20041	20046	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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396	NC_005027	GTA	2	6	20179	20184	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	32470690
397	NC_005027	GAA	2	6	20197	20202	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	32470690
398	NC_005027	ACT	2	6	20224	20229	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	32470690
399	NC_005027	TCT	2	6	20235	20240	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	32470690
400	NC_005027	AGC	2	6	20243	20248	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	32470690
401	NC_005027	TCG	2	6	20315	20320	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	32470690
402	NC_005027	AGC	2	6	20321	20326	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	32470690
403	NC_005027	CCAG	2	8	20400	20407	25 %	0 %	25 %	50 %	32470690
404	NC_005027	TCA	2	6	20517	20522	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	32470690
405	NC_005027	GA	3	6	20569	20574	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
406	NC_005027	AGC	2	6	20688	20693	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	32470691
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409	NC_005027	GGAAG	2	10	20815	20824	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
410	NC_005027	TG	3	6	20885	20890	0 %	50 %	50 %	0 %	32470692
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435	NC_005027	TCGT	2	8	22043	22050	0 %	50 %	25 %	25 %	32470694
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440	NC_005027	AAG	2	6	22268	22273	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	32470694
441	NC_005027	TGA	2	6	22330	22335	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
442	NC_005027	AC	3	6	22372	22377	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
443	NC_005027	AGCG	2	8	22384	22391	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
444	NC_005027	CAGC	2	8	22455	22462	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
445	NC_005027	CGATT	2	10	22621	22630	20 %	40 %	20 %	20 %	32470695
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481	NC_005027	AATG	2	8	24629	24636	50 %	25 %	25 %	0 %	32470698
482	NC_005027	TTGA	2	8	24658	24665	25 %	50 %	25 %	0 %	32470698
483	NC_005027	TGG	2	6	24701	24706	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	32470698
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492	NC_005027	GAA	2	6	25367	25372	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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495	NC_005027	ACTC	2	8	25559	25566	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
496	NC_005027	TGG	2	6	25706	25711	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	32470702
497	NC_005027	A	6	6	25794	25799	100 %	0 %	0 %	0 %	32470702
498	NC_005027	TTG	2	6	25815	25820	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	32470702
499	NC_005027	ATCA	2	8	25912	25919	50 %	25 %	0 %	25 %	32470702
500	NC_005027	TGCG	2	8	25961	25968	0 %	25 %	50 %	25 %	32470702

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